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lncRNA測(cè)序
(long non-coding RNA,lncRNA )
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技術(shù)待認(rèn)領(lǐng)

圖片來(lái)源:www.biogo.net

技術(shù)概述

長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一類轉(zhuǎn)錄本長(zhǎng)度超過(guò)200nt、不編碼蛋白的RNA。起初被認(rèn)為是基因組轉(zhuǎn)錄的“噪音”,是RNA聚合酶II轉(zhuǎn)錄的副產(chǎn)物,不具有生物學(xué)功能。然而,近年來(lái)的研究表明,LncRNA參與了X染色體沉默(圖A),基因組印記以及染色質(zhì)修飾,轉(zhuǎn)錄激活(圖B),轉(zhuǎn)錄干擾,核內(nèi)運(yùn)輸?shù)榷喾N重要的調(diào)控過(guò)程,LncRNA的這些調(diào)控作用也開(kāi)始引起人們廣泛的關(guān)注。

圖A:LncRNA參與X染色體的沉默;圖B:LncRNA參與基因的轉(zhuǎn)錄激活。

哺乳動(dòng)物基因組序列中4%~9%的序列產(chǎn)生的轉(zhuǎn)錄本是LncRNA(相應(yīng)的蛋白編碼RNA的比例是1%),雖然近年來(lái)關(guān)于LncRNA的研究進(jìn)展迅猛,但是絕大部分LncRNA的功能仍不清楚,隨著研究的推進(jìn),各類 LncRNA 的大量發(fā)現(xiàn),LncRNA 的研究將是 RNA 基因組研究非常吸引人的一個(gè)方向,使人們逐漸認(rèn)識(shí)到基因組存在人類知之甚少的“暗物質(zhì)”。

LncRNA作為RNA研究的熱點(diǎn),在表觀遺傳、轉(zhuǎn)錄以及轉(zhuǎn)錄后等多種水平上調(diào)控編碼基因的表達(dá),對(duì)物種的遺傳改良、疾病的發(fā)生發(fā)展及診斷治療有重要作用。相比傳統(tǒng)的芯片檢測(cè),LncRNA測(cè)序結(jié)合高通量測(cè)序技術(shù)及生物信息學(xué)方法,能夠在整體水平上、全面挖掘樣品中LncRNA以及mRNA的信息。

利用新一代高通量測(cè)序技術(shù)進(jìn)行l(wèi)ncRNA測(cè)序,并結(jié)合生物信息學(xué)的預(yù)測(cè)工具進(jìn)行l(wèi)ncRNA分析,有助于科研工作者更快發(fā)現(xiàn)那些具有重要調(diào)控功能的lncRNA,分析其與特定生物學(xué)過(guò)程的關(guān)系。該方法可以更加高效地獲取lncRNA序列以及位置信息,且突破了常規(guī)lncRNA芯片檢測(cè)技術(shù)的使用范圍限制,還可對(duì)新的lncRNA進(jìn)行預(yù)測(cè)及功能分析,極大促進(jìn)lncRNA的深入研究。

(資料來(lái)源:美吉生物、漢恒生物、百邁客,聚生物整理)

技術(shù)詳情

(XXX編輯,XXX修善)

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