簡(jiǎn)化基因組測(cè)序
(Reduced-Representation Genome Sequencing，RRGS)
技術(shù)概述
簡(jiǎn)化基因組測(cè)序（Reduced-Representation Genome Sequencing，RRGS）是指利用限制性內(nèi)切酶打斷基因組DNA，對(duì)特定片段進(jìn)行高通量測(cè)序獲得海量遺傳多態(tài)性標(biāo)簽序列來(lái)充分代表目標(biāo)物種全基因組信息的測(cè)序策略。此方法實(shí)驗(yàn)步驟簡(jiǎn)單，成本低，而且可以不依賴參考基因組，就能獲得全基因組范圍內(nèi)的遺傳多態(tài)性標(biāo)簽，因而廣泛應(yīng)用于生態(tài)學(xué)，進(jìn)化學(xué)和基因組學(xué)等領(lǐng)域。
簡(jiǎn)化基因組能獲得全基因組范圍內(nèi)有代表性的遺傳多樣性位點(diǎn)，因而廣泛應(yīng)用于群體進(jìn)化、群體結(jié)構(gòu)、種群歷史、遺傳定位和連鎖圖譜的構(gòu)建。
技術(shù)詳情
大規(guī)?；蚍中驮谶z傳相關(guān)性研究中起著重要作用，尤其是和高通量測(cè)序技術(shù)結(jié)合后，它為基因挖掘帶來(lái)了新的機(jī)遇。大規(guī)?；蚍中偷挠行Ы鉀Q方法：SLAF-seq（specific-locus amplified fragment sequencing），該技術(shù)前期利用生物信息學(xué)方法，對(duì)目標(biāo)物種的參考基因組（或已知BAC序列）進(jìn)行系統(tǒng)分析，設(shè)計(jì)標(biāo)記開(kāi)發(fā)方案，后期根據(jù)前期的方案，構(gòu)建SLAF-seq文庫(kù)，篩選特異性長(zhǎng)度片段進(jìn)行高通量測(cè)序，將獲得測(cè)序深度和質(zhì)量滿足要求的SLAF片段來(lái)代表目標(biāo)物種的全基因組信息。它具有以下優(yōu)勢(shì):
1. 高深度測(cè)序保證分型準(zhǔn)確；
2. 簡(jiǎn)化的策略降低測(cè)序成本；
3. 前期簡(jiǎn)化方案預(yù)測(cè)保障標(biāo)記數(shù)量最優(yōu)；
4. 采用double index技術(shù)能適用于大群體。
簡(jiǎn)化基因組能獲得全基因組范圍內(nèi)有代表性的遺傳多樣性位點(diǎn)，因而廣泛應(yīng)用于群體進(jìn)化、群體結(jié)構(gòu)、種群歷史、遺傳定位和連鎖圖譜的構(gòu)建。
聚生物技術(shù)詞條修善計(jì)劃
對(duì)現(xiàn)在的詞條不滿意？或者您有關(guān)于該技術(shù)的獨(dú)特見(jiàn)解，最新發(fā)展資訊？都可以投稿給聚生物。一經(jīng)采用，您對(duì)該詞條的貢獻(xiàn)將被聚生物所有用戶所看到。
投稿參加技術(shù)詞條修善計(jì)劃
廣州-表觀生物
上海-派森諾生物
上海-凌恩生物
深圳-承啟生物
杭州-晶佰生物
武漢-基諾賽克
北京-博云華康
杭州-開(kāi)泰生物
做簡(jiǎn)化基因組測(cè)序，需要懂點(diǎn)啥