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交聯(lián)-免疫沉淀法
Crosslinking-immunprecipitation high-throughputsequencing, CLIP
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技術(shù)待認(rèn)領(lǐng)

技術(shù)概述

CLIP,交聯(lián)-免疫沉淀法,是一種主要用于分離和鑒定細(xì)胞中核糖核蛋白復(fù)合體中的RNA、microRNA以及蛋白復(fù)合物的方法。這個(gè)方法可以確定某些RBP是否能與特定的RNA結(jié)合并將RBPs與其結(jié)合的RNA免疫沉淀下來。

交聯(lián)-免疫沉淀法(CLIP)及PAR-CLIP技術(shù)是讓活體細(xì)胞被暴露在紫外燈下,使得RNA-蛋白結(jié)合起來并且可以用免疫共沉淀的方法使特異性的蛋白以及與其結(jié)合RNA一同被分離出來,進(jìn)一步通過高通量測序鑒定RNA類型。

PAR-CLIP-Seq應(yīng)用于miRNA靶基因分析能夠非常明顯地降低miRNA結(jié)合位點(diǎn)的假陽性預(yù)測頻率并且減小miRNA結(jié)合位點(diǎn)搜尋空間的范圍。可以在全基因組范圍內(nèi)鑒定AGO2蛋白在不同RNA上的結(jié)合位點(diǎn)。

(資料來源:伯信生物)

技術(shù)詳情

(XXX編輯,XXX修善)

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